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Proyecto: ANÁLISIS TRANSCRIPTÓMICO Y EXPRESIÓN GÉNICA DE HÍBRIDOS DE ABULÓN HALIOTIS SPP DEL PACÍFICO NORORIENTAL 
Responsable: Fabiola  Lafarga  De la Cruz
Tipo de proyecto: Proyecto Conacyt
Resumen: La hibridación, definida como el cruce de individuos o poblaciones genéticamente distintas, permite producir híbridos viables entre diferentes cepas, variedades, especies o inclusive géneros. En la naturaleza, los híbridos desempeñan un papel evolutivo importante en el incremento de la variabilidad genética y la especiación; permitiendo la formación de especies híbridas, híbridos adaptados a nuevos ecotonos, o bien, el reforzamiento de las barreras reproductivas a través de la selección en contra de los híbridos. Por otra parte, el fenómeno de heterosis (vigor híbrido), mediante el cual la progenie híbrida exhibe mayor biomasa, velocidad de desarrollo y crecimiento ó fecundidad que sus especies parentales, fue inicialmente caracterizado por Darwin (1876), y su redescubrimiento en el maíz, hace un siglo, ha revolucionado la crianza y producción de plantas y animales. La producción de maíz se ha incrementado seis veces desde la introducción de híbridos en 1920, y representa el 65% del total producido. Sin embargo, a nivel molecular, los principios que controlan la heterosis no han sido dilucidados en su totalidad; a pesar de que su estudio se ha realizado con dos aproximaciones moleculares, una relacionada con la organización del genoma y, otra directamente con la expresión génica de algunos genes seleccionados. Hasta ahora, la identificación y función de genes relacionados con la heterosis en animales se desconoce, y son pocos los estudios que han identificado genes diferencialmente expresados en híbridos de plantas (arroz y maíz). Por otra parte, las nuevas técnicas de secuenciación masiva transcriptómica permiten el estudio exploratorio y de novo de organismos no-modelo, para identificar un gran número de marcadores moleculares y genes candidatos asociados a caracteres de interés (p. ej. crecimiento, supervivencia, etc.). En especies marinas, un grupo importante de moluscos donde se han estudiado los procesos de hibridación son los abulones, organismos pertenecientes al género único Haliotis spp. que se encuentran ampliamente distribuidos a nivel mundial.

Existen evidencias de hibridación natural y procesos de introgresión entre especies simpátricas de abulones en las costas de California, Australia y Japón; y las experiencias de hibridación artificial intra e inter-específica han demostrado que es posible su mejoramiento genético por efecto de heterosis en crecimiento, supervivencia, tolerancia térmica y respuesta inmune. Sin embargo, a pesar de números estudios de hibridación natural e inducida, la significancia evolutiva de este proceso y la importancia del vigor híbrido en la producción de organismos acuáticos, es escaso el conocimiento de la arquitectura genética de las progenies híbridas y las respuestas transcriptómicas asociadas a la heterosis observada en caracteres cuantitativos. Por ello, los objetivos generales de la presente propuesta de investigación son: 1) producir y evaluar el desempeño, en crecimiento y supervivencia, de híbridos inter-específicos entre abulones del Pacífico Norte con diferentes grados de diferenciación genética y, 2) caracterizar el transcriptoma de las cruzas hetero-específicas que presenten heterosis (vigor híbrido) en dichos caracteres, mediante la técnica de secuenciación transcriptómica de alto rendimiento (RNA-Seq). Este análisis a nivel transcriptómico, permitirá identificar genes diferencialmente expresados en líneas puras (especies parentales) y sus progenies híbridas (líneas hibridas), que estén asociados a diferentes grados de heterosis en crecimiento y supervivencia. Además de permitir identificar marcadores moleculares asociados a genes funcionales (tipo SNP y SSR), aplicables a estudios de genética poblacional, para evaluar diversidad y estructura genética, adaptación local y procesos de introgresión y mezcla genética, entre poblaciones y especies.
Vigencia: (2015-05-06 - 2018-10-04)

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