Proyecto: | Genómica de organismos acuáticos |
Responsable: | Fabiola Lafarga De la Cruz |
Tipo de proyecto: | Proyecto Interno |
Resumen: | La aplicación de métodos genómicos en organismos acuáticos está en sus comienzos, pero avanza decididamente debido a la importancia socioeconómica y/o ecológica de estos recursos; ya sea en las actividades productivas de pesca y acuicultura, como en actividades de conservación de la biodiversidad y del acervo genético. La genómica engloba un conjunto de técnicas y metodologÃas dirigidas al estudio de la estructura y función del genoma completo (o de una fracción grande del mismo), en contraposición al enfoque clásico de la biologÃa molecular, que sólo permite estudiar uno o unos pocos genes a la vez. Por ello, la genómica ha revolucionado la forma de estudiar los fenómenos biológicos en organismos no modelo. Éste es el caso de la mayorÃa de los organismos acuáticos, de los cuales hay poca o nula información genética. Por otra parte, los métodos genómicos tienen gran potencial para resolver problemas relacionados directamente con el cultivo de los organismos y facilitar el desarrollo de soluciones, biotecnológicas o de otro tipo, a estos problemas. Por ejemplo, la aplicación de metodologÃas de transcriptómica está permitiendo avanzar en el conocimiento del sistema inmune de los moluscos, y los genes implicados en la respuesta a organismos patógenos; asà como las bases genéticas de la heterosis (vigor hÃbrido; Saavedra & Bachère, 2006). Más aún, gracias al uso de herramientas genómicas se pueden identificar genes candidatos relacionados con las respuestas fisiológicas de resistencia a enfermedades, tolerancia a estrés ambiental (p.ej. temperatura, salinidad, pH, etc.), desarrollo larvario, maduración gonadal, asà como los mecanismos moleculares de determinación de sexo y del control del crecimiento. Todos éstos son caracteres de interés productivo en la industria acuÃcola. Por otra parte, a nivel de poblaciones silvestres, el estudio amplio del transcriptoma ha permitido identificar genéticamente fenotipos con adaptaciones locales en un gran número de genes involucrados en los procesos de biomineralización, metabolismo energético o tolerancia a temperaturas elevadas, enfermedades y niveles bajos de oxÃgeno (abulón rojo de California; Wit et al., 2012). Estos estudios permiten evaluar la respuesta, a nivel de expresión génica, de los organismos silvestres en un amplio rango de condiciones ambientales e identificar zonas de alta diversidad genética (riqueza) para implementar estrategias de manejo y conservación de recursos acuáticos pesqueros de importancia comercial. Considerando que la genómica facilita el estudio biológico de los organismos acuáticos e incrementa en varios órdenes de magnitud la cantidad de conocimiento que se puede extraer, este proyecto plantea implementar métodos genómicos (p.ej. secuenciación masiva (RNA-Seq), genotipificado por secuenciación (GBS), entre otras) para el estudio de organismos acuáticos (invertebrados y peces marinos, principalmente) de interés económico y ecológico en Baja California, México. Con la finalidad de generar información acerca de la arquitectura genética de los organismos, que sea aplicable en las áreas de acuicultura y pesquerÃas, para mejorar la producción en cautiverio e implementar medidas de manejo pesquero adecuadas para la conservación de los recursos acuáticos. México cuenta con un gran potencial para el desarrollo de la maricultura, gracias a sus 11,500 km de litoral con una plataforma continental de 357,800 km2 y 1.5 millones de hectáreas en cuerpos costeros con caracterÃsticas oceanográficas apropiadas para la acuicultura, asà como una amplia diversidad de especies con alta demanda en el mercado nacional e internacional. De forma particular, Baja California destaca por su producción de moluscos, bivalvos principalmente; y en años recientes por el impulso que se ha dado al cultivo (o engorda) de peces marinos de alto valor comercial. |
Vigencia: | (2013-09-04 - 2020-12-31) |
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